Významná ocenění členů společnosti
- Státní cena:
- F. Heřmanský, P. Pudlák – Za jimi objevený syndrom Heřmanského a Pudláka
- K. Smetana (1986) – Za objevné práce o strukturách a funkci jadérka
- Cena ministra zdravotnictví:
- K. Smetana (1974) – Za práci o prsténčitých jadérkách ve zralých lymfocytech
- Státní vyznamenání – Medaile za zásluhy o stát v oblasti vědy: P. Klener
- Strattonova cena ISH: F. Heřmanský
- W. Bernhard medal (IWCN):
- K. Smetana (1996) – For contributions to the structural organitation of the cell nucleus
- Zlatá medaile Slovenské lékařské společnosti: L. Chrobák, K. Smetana
- Zlatá medaile České lékařské společnosti JEP: K. Indrák
- Hlávkova medaile za přínos české a světové vědě: K. Smetana (2013)
- Zlatá medaile za zásluhy o veterinární lékařství: K. Smetana (1990)
- Čestný diplom za mimořádné zásluhy o české zdravotnictví: K. Smetana (2005)
Čestná členství v ostatních národních společnostech
- Česká Histochemická společnost: K. Smetana
- Česká a Slovenská biologická společnost: K. Smetana
Čestná členství v mezinárodních společnostech
- Polská hematologická společnost: F. Heřmanský, L. Chrobák, J. Krč, B. Wiedermann
- Maďarská hematologická společnost: L. Chrobák
- Slovenská hematologická a transfuziologická společnost: L. Chrobák, K. Indrák, P. Klener, J. Malý, M. Pecka, K. Smetana, J. Vaňásek
- Gruzinská hematologická společnost: K. Smetana
- Mezinárodní výbor International Workshop on the Cell Nucleus: K. Smetana
Zlatá pamětní medaile ČLS JEP
- Indrák Karel Prof. MUDr. DrSc. – 2012
Cena J.E. Purkyně
- prof. MUDr. Otto Hrodek, DrSc. – 2022
- Klener Pavel Prof. MUDr. DrSc. – 2011
- Chrobák Ladislav Prof. MUDr. CSc. – 2007
Čestná medaile ČLS JEP
- Lukášová Marcela MUDr. – 2021
- Čermák Jaroslav, prof. MUDr. CSc. – 2014
- Drobníková Zdeňka – 2014
- Matýšková Miloslava MUDr. CSc. – 2014
- Hrodek Otto Prof. MUDr. CSc. – 2012
- Kubisz Peter Prof. MUDr. DrSc – 2012
- Pecka Miroslav Doc. RNDr. CSc. – 2012
- Penka Miroslav Prof. MUDr. CSc. – 2012
- Vorlová Zdeňka MUDr. CSc. – 2009
- Bláha Milan Prof. MUDr. CSc. – 2008
- Horák Jiří MUDr. – 2006
- Indrák Karel Prof. MUDr. DrSc. – 2006
- Malý Jaroslav Prof. MUDr. CSc. – 2006
- Smetana Karel Prof. MUDr. DrSc. – 2006
- Cieslar Petr Doc. MUDr. CSc. – 2005
- Koza Vladimír MUDr. – 2005
- Starý Jan Prof. MUDr. DrSc. – 2005
- Brdička Radim Prof. MUDr. DrSc. – 2003
- Chudomel Vladimír MUDr. CSc. – 2003
- Kvasnička Jan Prof. MUDr. DrSc. – 2003
- Nedvěd Josef MUDr. – 2003
- Valníček Svatopluk MUDr. – 2003
- Klener Pavel Prof. MUDr. DrSc. – 2002
- Brabec Václav MUDr. DrSc. – 1999
- Neuwirtová Radana Doc. MUDr. CSc. – 1999
- Procházka Josef Prof. MUDr. CSc. – 1999
- Ščudla Vlastimil Prof. MUDr. CSc. – 1996
- Hnízdová Dagmar – 1995
- Karlíčková Milada MUDr. – 1995
- Lexová Stanislava – 1995
- Erbanová Eva MUDr. – 1992
- Fiala Jaroslav MUDr. CSc. – 1992
- Chrobák Ladislav Prof. MUDr. CSc. – 1992
- Krč Ivo Prof. MUDr. DrSc. – 1992
- Krišlo Vladimír Doc. MUDr. CSc. – 1992
- Kselíková Marie Ing. – 1992
- Kulich Vladimír MUDr. – 1992
- Lukášová Marcela – 1992
- Matěja František MUDr. – 1992
- Neuwirt Jan Prof. MUDr. DrSc. – 1992
- Skala Evžen Prof. MUDr. CSc. – 1992
- Šmrhová Irma MUDr. – 1992
- Švanda Miloslav MUDr. CSc. – 1992
- Vaňásek Jaroslav Prof. MUDr. CSc. – 1992
- Veselý Vladimír MUDr. CSc. – 1992
- Vojtová Dana MUDr. – 1992